Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cdk5P49615 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk5P49615 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms