Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GdnfP48540 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GdnfP48540 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GdnfP48540 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GdnfP48540 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GdnfP48540 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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