Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcd1P48410 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms