Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Resp18P47939 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Resp18P47939 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Resp18P47939 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Resp18P47939 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Resp18P47939 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Resp18P47939 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Resp18P47939 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Resp18P47939 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Resp18P47939 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Resp18P47939 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms