Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CratP47934 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CratP47934 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CratP47934 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CratP47934 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CratP47934 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CratP47934 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CratP47934 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CratP47934 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CratP47934 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CratP47934 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CratP47934 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CratP47934 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CratP47934 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CratP47934 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CratP47934 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CratP47934 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CratP47934 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CratP47934 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CratP47934 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CratP47934 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CratP47934 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CratP47934 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CratP47934 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CratP47934 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CratP47934 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CratP47934 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CratP47934 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CratP47934 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CratP47934 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CratP47934 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CratP47934 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CratP47934 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CratP47934 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CratP47934 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CratP47934 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CratP47934 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CratP47934 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CratP47934 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CratP47934 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CratP47934 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CratP47934 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CratP47934 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CratP47934 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CratP47934 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CratP47934 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CratP47934 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CratP47934 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CratP47934 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CratP47934 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CratP47934 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CratP47934 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CratP47934 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CratP47934 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CratP47934 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CratP47934 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CratP47934 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CratP47934 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CratP47934 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CratP47934 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CratP47934 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CratP47934 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CratP47934 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CratP47934 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CratP47934 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CratP47934 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CratP47934 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CratP47934 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CratP47934 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CratP47934 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CratP47934 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CratP47934 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CratP47934 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CratP47934 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CratP47934 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CratP47934 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CratP47934 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CratP47934 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CratP47934 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CratP47934 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CratP47934 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CratP47934 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CratP47934 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CratP47934 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CratP47934 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CratP47934 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CratP47934 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CratP47934 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CratP47934 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CratP47934 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CratP47934 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CratP47934 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CratP47934 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CratP47934 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CratP47934 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CratP47934 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CratP47934 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CratP47934 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CratP47934 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CratP47934 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms