Protein–RNA interactions for Protein: P46660

Ina, Alpha-internexin, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InaP46660 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
InaP46660 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
InaP46660 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
InaP46660 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
InaP46660 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
InaP46660 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
InaP46660 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
InaP46660 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
InaP46660 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
InaP46660 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
InaP46660 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
InaP46660 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
InaP46660 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
InaP46660 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
InaP46660 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
InaP46660 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
InaP46660 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
InaP46660 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
InaP46660 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
InaP46660 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
InaP46660 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
InaP46660 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
InaP46660 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
InaP46660 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
InaP46660 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
InaP46660 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
InaP46660 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
InaP46660 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
InaP46660 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
InaP46660 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
InaP46660 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
InaP46660 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
InaP46660 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
InaP46660 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
InaP46660 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
InaP46660 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
InaP46660 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
InaP46660 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
InaP46660 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
InaP46660 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
InaP46660 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
InaP46660 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
InaP46660 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
InaP46660 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
InaP46660 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
InaP46660 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
InaP46660 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
InaP46660 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
InaP46660 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
InaP46660 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
InaP46660 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
InaP46660 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
InaP46660 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
InaP46660 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
InaP46660 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
InaP46660 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
InaP46660 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
InaP46660 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
InaP46660 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
InaP46660 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
InaP46660 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
InaP46660 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
InaP46660 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
InaP46660 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
InaP46660 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
InaP46660 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
InaP46660 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
InaP46660 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
InaP46660 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
InaP46660 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
InaP46660 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
InaP46660 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
InaP46660 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
InaP46660 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
InaP46660 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
InaP46660 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
InaP46660 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
InaP46660 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
InaP46660 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
InaP46660 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
InaP46660 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
InaP46660 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
InaP46660 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
InaP46660 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
InaP46660 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
InaP46660 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
InaP46660 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
InaP46660 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
InaP46660 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
InaP46660 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
InaP46660 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
InaP46660 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
InaP46660 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
InaP46660 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
InaP46660 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
InaP46660 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
InaP46660 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
InaP46660 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
InaP46660 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
InaP46660 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms