Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PtgfrP43117 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtgfrP43117 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms