Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pik3caP42337 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pik3caP42337 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms