Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl28P41105 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rpl28P41105 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
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