Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VhlP40338 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VhlP40338 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VhlP40338 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VhlP40338 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14□□□□□ -0.17
VhlP40338 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VhlP40338 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VhlP40338 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VhlP40338 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
VhlP40338 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VhlP40338 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VhlP40338 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VhlP40338 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
VhlP40338 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
VhlP40338 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VhlP40338 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VhlP40338 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VhlP40338 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
VhlP40338 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VhlP40338 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VhlP40338 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
VhlP40338 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VhlP40338 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VhlP40338 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VhlP40338 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
VhlP40338 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VhlP40338 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
VhlP40338 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VhlP40338 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VhlP40338 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VhlP40338 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VhlP40338 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VhlP40338 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VhlP40338 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VhlP40338 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VhlP40338 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VhlP40338 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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VhlP40338 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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VhlP40338 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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VhlP40338 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VhlP40338 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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VhlP40338 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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VhlP40338 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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VhlP40338 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VhlP40338 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VhlP40338 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VhlP40338 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VhlP40338 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VhlP40338 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VhlP40338 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VhlP40338 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VhlP40338 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VhlP40338 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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VhlP40338 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VhlP40338 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VhlP40338 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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VhlP40338 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VhlP40338 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VhlP40338 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VhlP40338 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VhlP40338 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VhlP40338 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VhlP40338 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VhlP40338 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VhlP40338 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VhlP40338 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VhlP40338 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VhlP40338 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VhlP40338 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VhlP40338 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VhlP40338 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VhlP40338 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VhlP40338 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VhlP40338 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VhlP40338 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VhlP40338 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VhlP40338 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VhlP40338 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
VhlP40338 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms