Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ThpoP40226 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ThpoP40226 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ThpoP40226 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ThpoP40226 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ThpoP40226 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ThpoP40226 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ThpoP40226 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ThpoP40226 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ThpoP40226 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms