Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chd1P40201 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chd1P40201 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Chd1P40201 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chd1P40201 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Chd1P40201 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chd1P40201 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chd1P40201 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chd1P40201 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chd1P40201 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms