Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Lig1P37913 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lig1P37913 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lig1P37913 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lig1P37913 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lig1P37913 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lig1P37913 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lig1P37913 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms