Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddit3P35639 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ddit3P35639 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms