Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sftpa1P35242 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sftpa1P35242 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms