Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Apoc1P34928 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apoc1P34928 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apoc1P34928 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apoc1P34928 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apoc1P34928 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apoc1P34928 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Apoc1P34928 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Apoc1P34928 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apoc1P34928 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apoc1P34928 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apoc1P34928 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apoc1P34928 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apoc1P34928 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apoc1P34928 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apoc1P34928 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Apoc1P34928 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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