Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ptk2P34152 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptk2P34152 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms