Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tfap2aP34056 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms