Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nedd1P33215 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms