Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cdh15P33146 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdh15P33146 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdh15P33146 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdh15P33146 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdh15P33146 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdh15P33146 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdh15P33146 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdh15P33146 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdh15P33146 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdh15P33146 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdh15P33146 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdh15P33146 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdh15P33146 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdh15P33146 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdh15P33146 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdh15P33146 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdh15P33146 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdh15P33146 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms