Protein–RNA interactions for Protein: P32115

Pax4, Paired box protein Pax-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax4P32115 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax4P32115 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax4P32115 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax4P32115 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax4P32115 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax4P32115 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax4P32115 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax4P32115 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax4P32115 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax4P32115 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax4P32115 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax4P32115 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms