Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxc11P31313 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxc11P31313 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms