Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc10P31257 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc10P31257 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc10P31257 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc10P31257 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms