Protein–RNA interactions for Protein: P30280

Ccnd2, G1/S-specific cyclin-D2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd2P30280 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccnd2P30280 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccnd2P30280 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccnd2P30280 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccnd2P30280 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccnd2P30280 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccnd2P30280 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnd2P30280 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnd2P30280 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnd2P30280 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnd2P30280 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnd2P30280 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnd2P30280 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnd2P30280 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnd2P30280 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnd2P30280 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnd2P30280 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnd2P30280 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccnd2P30280 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnd2P30280 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnd2P30280 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnd2P30280 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnd2P30280 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnd2P30280 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnd2P30280 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnd2P30280 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnd2P30280 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnd2P30280 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnd2P30280 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnd2P30280 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnd2P30280 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnd2P30280 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnd2P30280 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnd2P30280 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnd2P30280 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms