Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RxrgP28705 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RxrgP28705 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RxrgP28705 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RxrgP28705 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RxrgP28705 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RxrgP28705 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RxrgP28705 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RxrgP28705 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RxrgP28705 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxrgP28705 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RxrgP28705 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms