Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CebpbP28033 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CebpbP28033 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CebpbP28033 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CebpbP28033 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CebpbP28033 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CebpbP28033 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CebpbP28033 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CebpbP28033 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CebpbP28033 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CebpbP28033 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CebpbP28033 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CebpbP28033 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CebpbP28033 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CebpbP28033 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CebpbP28033 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CebpbP28033 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CebpbP28033 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CebpbP28033 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CebpbP28033 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CebpbP28033 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CebpbP28033 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CebpbP28033 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CebpbP28033 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CebpbP28033 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CebpbP28033 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CebpbP28033 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CebpbP28033 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CebpbP28033 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CebpbP28033 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms