Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Xrcc5P27641 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Xrcc5P27641 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms