Protein–RNA interactions for Protein: P25918

Cd19, B-lymphocyte antigen CD19, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd19P25918 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd19P25918 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd19P25918 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd19P25918 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd19P25918 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd19P25918 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd19P25918 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd19P25918 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd19P25918 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd19P25918 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd19P25918 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cd19P25918 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms