Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmo2P25801 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms