Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccnd1P25322 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccnd1P25322 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms