Protein–RNA interactions for Protein: P23979

Htr3a, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3aP23979 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Htr3aP23979 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Htr3aP23979 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms