Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Med21-203ENSMUST00000111650 572 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm45379-201ENSMUST00000211772 549 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm10053-201ENSMUST00000073080 949 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Gm42794-201ENSMUST00000197636 835 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Tmem156-201ENSMUST00000043352 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Krr1-204ENSMUST00000174653 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Gm44138-201ENSMUST00000204939 271 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Gm31763-201ENSMUST00000217788 673 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Tas2r142-ps5-201ENSMUST00000204651 929 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Gm15379-201ENSMUST00000121224 648 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Olfr1032-201ENSMUST00000062166 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Olfr749-202ENSMUST00000214290 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 A930041C12Rik-201ENSMUST00000149156 537 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd11P23813 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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