Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkchP23298 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkchP23298 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkchP23298 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkchP23298 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrkchP23298 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms