Protein–RNA interactions for Protein: P23198

Cbx3, Chromobox protein homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx3P23198 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cbx3P23198 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms