Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpcP21841 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpcP21841 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpcP21841 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpcP21841 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpcP21841 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SftpcP21841 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms