Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lmnb2P21619 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lmnb2P21619 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lmnb2P21619 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lmnb2P21619 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmnb2P21619 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmnb2P21619 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lmnb2P21619 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms