Protein–RNA interactions for Protein: P21460

Cst3, Cystatin-C, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cst3P21460 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cst3P21460 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cst3P21460 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cst3P21460 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cst3P21460 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cst3P21460 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cst3P21460 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cst3P21460 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cst3P21460 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cst3P21460 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cst3P21460 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms