Protein–RNA interactions for Protein: P21275

Bmp4, Bone morphogenetic protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp4P21275 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bmp4P21275 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bmp4P21275 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bmp4P21275 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Bmp4P21275 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bmp4P21275 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bmp4P21275 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bmp4P21275 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bmp4P21275 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bmp4P21275 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bmp4P21275 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bmp4P21275 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bmp4P21275 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bmp4P21275 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bmp4P21275 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bmp4P21275 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Bmp4P21275 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bmp4P21275 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bmp4P21275 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bmp4P21275 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bmp4P21275 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bmp4P21275 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bmp4P21275 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bmp4P21275 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bmp4P21275 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bmp4P21275 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bmp4P21275 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bmp4P21275 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bmp4P21275 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bmp4P21275 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bmp4P21275 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bmp4P21275 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bmp4P21275 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bmp4P21275 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bmp4P21275 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bmp4P21275 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bmp4P21275 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bmp4P21275 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bmp4P21275 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms