Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxb9P20615 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb9P20615 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms