Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P20040 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P20040 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P20040 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P20040 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P20040 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P20040 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P20040 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P20040 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P20040 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P20040 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P20040 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P20040 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P20040 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P20040 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P20040 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P20040 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P20040 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P20040 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P20040 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P20040 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P20040 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P20040 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P20040 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P20040 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P20040 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P20040 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P20040 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P20040 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P20040 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P20040 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P20040 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P20040 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P20040 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P20040 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P20040 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P20040 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P20040 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P20040 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P20040 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P20040 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P20040 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P20040 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P20040 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P20040 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P20040 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P20040 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P20040 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P20040 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P20040 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P20040 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P20040 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P20040 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P20040 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P20040 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P20040 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P20040 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P20040 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P20040 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P20040 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P20040 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P20040 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P20040 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P20040 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P20040 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P20040 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P20040 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P20040 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P20040 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P20040 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P20040 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P20040 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P20040 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P20040 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P20040 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P20040 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P20040 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P20040 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P20040 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P20040 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P20040 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P20040 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P20040 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P20040 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P20040 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P20040 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P20040 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P20040 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P20040 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P20040 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P20040 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P20040 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P20040 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P20040 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P20040 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P20040 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P20040 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P20040 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P20040 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P20040 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms