Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms