Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Defa-rs1P17533 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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Defa-rs1P17533 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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Defa-rs1P17533 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Defa-rs1P17533 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa-rs1P17533 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms