Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sptan1P16546 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sptan1P16546 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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