Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ass1P16460 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ass1P16460 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ass1P16460 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ass1P16460 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ass1P16460 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ass1P16460 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ass1P16460 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ass1P16460 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ass1P16460 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ass1P16460 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ass1P16460 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ass1P16460 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ass1P16460 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ass1P16460 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ass1P16460 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ass1P16460 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ass1P16460 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ass1P16460 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ass1P16460 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ass1P16460 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ass1P16460 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ass1P16460 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ass1P16460 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ass1P16460 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ass1P16460 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ass1P16460 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ass1P16460 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ass1P16460 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ass1P16460 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ass1P16460 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ass1P16460 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ass1P16460 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ass1P16460 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ass1P16460 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ass1P16460 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ass1P16460 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ass1P16460 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms