Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vpreb1P13372 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb1P13372 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms