Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr4a1P12813 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr4a1P12813 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms