Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtcP11725 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtcP11725 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtcP11725 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtcP11725 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtcP11725 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtcP11725 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtcP11725 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtcP11725 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtcP11725 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtcP11725 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtcP11725 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtcP11725 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtcP11725 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtcP11725 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtcP11725 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtcP11725 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OtcP11725 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtcP11725 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtcP11725 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtcP11725 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtcP11725 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtcP11725 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtcP11725 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtcP11725 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtcP11725 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
OtcP11725 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
OtcP11725 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
OtcP11725 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
OtcP11725 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtcP11725 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtcP11725 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtcP11725 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
OtcP11725 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtcP11725 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtcP11725 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtcP11725 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtcP11725 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtcP11725 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtcP11725 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtcP11725 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtcP11725 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtcP11725 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OtcP11725 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
OtcP11725 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
OtcP11725 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
OtcP11725 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
OtcP11725 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
OtcP11725 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
OtcP11725 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OtcP11725 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OtcP11725 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OtcP11725 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OtcP11725 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OtcP11725 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OtcP11725 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OtcP11725 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OtcP11725 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
OtcP11725 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
OtcP11725 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
OtcP11725 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtcP11725 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtcP11725 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtcP11725 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtcP11725 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtcP11725 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtcP11725 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtcP11725 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtcP11725 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtcP11725 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtcP11725 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtcP11725 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtcP11725 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtcP11725 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtcP11725 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtcP11725 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtcP11725 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
OtcP11725 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtcP11725 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
OtcP11725 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtcP11725 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtcP11725 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtcP11725 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtcP11725 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtcP11725 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
OtcP11725 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtcP11725 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtcP11725 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtcP11725 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtcP11725 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtcP11725 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtcP11725 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtcP11725 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtcP11725 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
OtcP11725 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtcP11725 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtcP11725 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtcP11725 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtcP11725 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
OtcP11725 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms