Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa1P11477 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa1P11477 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa1P11477 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa1P11477 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms