Protein–RNA interactions for Protein: P10855

Ccl3, C-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl3P10855 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl3P10855 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl3P10855 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl3P10855 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl3P10855 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl3P10855 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl3P10855 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl3P10855 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl3P10855 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl3P10855 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl3P10855 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl3P10855 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl3P10855 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccl3P10855 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl3P10855 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl3P10855 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl3P10855 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl3P10855 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl3P10855 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl3P10855 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl3P10855 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl3P10855 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl3P10855 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl3P10855 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl3P10855 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl3P10855 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl3P10855 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl3P10855 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl3P10855 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl3P10855 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl3P10855 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl3P10855 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl3P10855 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl3P10855 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccl3P10855 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccl3P10855 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl3P10855 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl3P10855 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl3P10855 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl3P10855 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl3P10855 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl3P10855 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl3P10855 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl3P10855 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl3P10855 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl3P10855 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl3P10855 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl3P10855 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl3P10855 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl3P10855 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl3P10855 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl3P10855 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl3P10855 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl3P10855 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl3P10855 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccl3P10855 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl3P10855 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl3P10855 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl3P10855 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl3P10855 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl3P10855 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl3P10855 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl3P10855 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl3P10855 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl3P10855 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl3P10855 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl3P10855 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl3P10855 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl3P10855 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl3P10855 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl3P10855 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl3P10855 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl3P10855 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl3P10855 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl3P10855 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl3P10855 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl3P10855 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl3P10855 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl3P10855 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl3P10855 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl3P10855 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl3P10855 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl3P10855 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl3P10855 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl3P10855 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl3P10855 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl3P10855 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl3P10855 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl3P10855 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl3P10855 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl3P10855 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl3P10855 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl3P10855 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl3P10855 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl3P10855 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl3P10855 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl3P10855 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl3P10855 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl3P10855 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl3P10855 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms