Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd4P10628 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms